Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM31Q9BZY9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM31Q9BZY9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms