Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIM8Q9BZR9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM8Q9BZR9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM8Q9BZR9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms