Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIH1Q9BYX4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFIH1Q9BYX4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms