Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM54Q9BYV2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms