Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNG6Q9BXT2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNG6Q9BXT2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms