Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUSAP1Q9BXS6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUSAP1Q9BXS6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms