Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
SYCP2Q9BX26 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
SYCP2Q9BX26 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SYCP2Q9BX26 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms