Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KIFC3Q9BVG8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KIFC3Q9BVG8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KIFC3Q9BVG8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFC3Q9BVG8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFC3Q9BVG8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KIFC3Q9BVG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms