Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM109Q9BVC6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms