Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KATNB1Q9BVA0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KATNB1Q9BVA0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms