Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1orf50Q9BV19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1orf50Q9BV19 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms