Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
C9orf16Q9BUW7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C9orf16Q9BUW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms