Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCMBPQ9BTE3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCMBPQ9BTE3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCMBPQ9BTE3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms