Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C16orf70Q9BSU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C16orf70Q9BSU1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms