Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM175Q9BSA9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM175Q9BSA9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM175Q9BSA9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms