Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SIKE1Q9BRV8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SIKE1Q9BRV8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms