Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3GL2Q99962 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3GL2Q99962 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3GL2Q99962 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL2Q99962 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL2Q99962 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL2Q99962 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL2Q99962 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3GL2Q99962 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms