Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MYD88Q99836 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYD88Q99836 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms