Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SIGMAR1Q99720 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SIGMAR1Q99720 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms