Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POP1Q99575 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP1Q99575 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP1Q99575 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP1Q99575 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP1Q99575 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP1Q99575 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP1Q99575 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms