Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP88Q99567 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms