Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EYA3Q99504 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms