Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPXM1Q96SM3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPXM1Q96SM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms