Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8L2Q96SF2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCT8L2Q96SF2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms