Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZIM3Q96PE6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIM3Q96PE6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIM3Q96PE6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms