Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGLYRP2Q96PD5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms