Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RDH12Q96NR8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RDH12Q96NR8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms