Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1Q96NA8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms