Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU6

ZNF778, Zinc finger protein 778, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF778Q96MU6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF778Q96MU6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF778Q96MU6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms