Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZSWIM3Q96MP5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZSWIM3Q96MP5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms