Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM20AQ96MK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM20AQ96MK3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms