Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FGD4Q96M96 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FGD4Q96M96 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FGD4Q96M96 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms