Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRIMPOLQ96LW4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRIMPOLQ96LW4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms