Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD3Q96L08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SUSD3Q96L08 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms