Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PRAC1Q96KF2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PRAC1Q96KF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms