Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SERAC1Q96JX3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SERAC1Q96JX3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms