Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms