Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCPIP1Q96JH7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCPIP1Q96JH7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms