Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SGSM3Q96HU1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms