Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MS4A3Q96HJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MS4A3Q96HJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms