Protein–RNA interactions for Protein: Q96H12

MSANTD3, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD3Q96H12 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MSANTD3Q96H12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MSANTD3Q96H12 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms