Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OTUB1Q96FW1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OTUB1Q96FW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OTUB1Q96FW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OTUB1Q96FW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
OTUB1Q96FW1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms