Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TVP23CQ96ET8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TVP23CQ96ET8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms