Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MALSU1Q96EH3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms