Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPDL1Q96EA4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPDL1Q96EA4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 440 ms