Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGBD4Q96DM1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms