Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
OTUB2Q96DC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
OTUB2Q96DC9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUB2Q96DC9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms