Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RMDN1Q96DB5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms