Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FAM3DQ96BQ1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FAM3DQ96BQ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FAM3DQ96BQ1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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FAM3DQ96BQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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FAM3DQ96BQ1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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FAM3DQ96BQ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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FAM3DQ96BQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FAM3DQ96BQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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