Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RFT1Q96AA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RFT1Q96AA3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms